許多時候,都需要無菌環境,無菌培養。例如細胞在體外培養時,為了保證無菌,有時需要加入抗生素。但長期加抗生素對細胞也不利。一些特殊實驗也需要不含抗生素。有沒有一種方法,可提早知道細胞是否有細菌污染呢?
有些客戶采用了德國Minerva Biolabs生產的細菌檢測試劑盒(英文名:Onar® Bacteria Detection Kit,貨號),它是PCR方法,可快速檢測生物樣品(包括細胞培養物和病毒貯存液)中是否存在細菌。該試劑盒引物針對細菌16s rRNA的高保守區,,可檢測超過45種細菌屬。
該試劑盒中的主要試劑均為凍干粉,性能穩定。它包含有:
凍干預混液:含引物/核苷酸/內控對照DNA /聚合酶
反應緩沖液
凍干的陽性對照DNA
PCR級水
樣本可以是細胞上清,樣本不用提DNA,但需要熱滅活(95 °C 5分鐘)。
樣本需不含抗生素。如含抗生素,則細胞應在不含抗生素的培養基中再培養至少一代。
細菌陽性擴增片段450 bp左右,內控對照擴增片段約140bp。
該試劑盒的檢測限為2.4×10的3次方細菌 /ml。
為避免假陽性,建議使用帶濾芯吸頭。
擴增后跑膠觀察條帶,即可判斷結果。示意圖如下:
圖. 內控對照顯示PCR反應正常,樣本中無PCR抑制成分。460bp左右存在目的條帶,提示存在細菌污染。
該產品有2篇引用文獻,如下:
1. Linow M., (2012). Mastermix 16S – Ultra Sensitive Detection of Microbial DNA. Research in Molecular Diagnostics, No. 2/12.
2. Simonsen Ø. et al., (2015). Characterization of the exte nt of a large outbreak of Legionnaires‘ disease by serological assays. BMC Infectious Diseases, 15:163. doi: 10.1186/s12879-015-0903-2.
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